En cuanto a su estrutura tenemos primero que las bases nitrogenadas se unen unicamente la adenina con la timina y la guanina con la citosina, estas uniones se dan mediante enlaces debiles de hidrógeno dos en la union de la adenina con la timina y tres en la union de la guanina con la citosina. La adenina y la timina se encuentran siempre ne una proporción casi igual o aproximada y la guanina con la citosina tienen porporcionen parecidas, además se unen de ésta manera para conservar la forma del ADN ya que al unir una base grande como lo son la adenina o la guanina con una pequeña como la citosina o timina se obtiene en cada union un tamaño similar en ambas.

Después tenemos el azúcar pentosa, la desoxirribosa la cual se une a las bases mediante enlaces de tipo N- glucocídico formando un nucleósido (desoxirribonucleósido). El enlace se forma a partir del carbono 1' de la desoxirribosa y se une en las bases púricas con el nitrógeno en la posición 9 y en las pirimidinas con el 1.

Para finalizar tenemos el grupo fosfato el cual se une al nucleósido mediante un enlace de tipo éster formando el nuecleótido. El ácido fosfórico o grupo fosfato es el encargado de unir una pentosa con otra, de ésta manera se encuentra unido al carbono 3' de una y el carbono 5' en la q le sigue, llamandosele así a sus enlaces fosfodiester.